Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ephb1Q8CBF3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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