Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC049762Q8C601 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms