Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms