Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms