Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca8Q8BHX3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms