Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnphQ80U23 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms