Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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