Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms