Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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