Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt39Q6IFX4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt39Q6IFX4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt39Q6IFX4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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