Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scaf8Q6DID3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms