Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms