Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprjQ64455 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprjQ64455 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms