Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkn2aQ64364 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms