Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SnrpcQ62241 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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