Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms