Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SkiQ60698 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SkiQ60698 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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