Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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