Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn13Q3UW68 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn13Q3UW68 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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