Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms