Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms