Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec31aQ3UPL0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms