Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms