Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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Usp19Q3UJD6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Usp19Q3UJD6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms