Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palb2Q3U0P1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms