Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c3Q3TMP1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms