Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam178bQ24JP3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam178bQ24JP3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms