Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms