Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms