Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tgm3Q08189 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgm3Q08189 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms