Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VcpQ01853 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms