Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mc1rQ01727 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms