Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H3f3aP84244 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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