Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms