Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tdrd6P61407 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tdrd6P61407 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tdrd6P61407 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Tdrd6P61407 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tdrd6P61407 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms