Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d1P61080 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d1P61080 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d1P61080 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d1P61080 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d1P61080 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms