Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap25P60879 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms