Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf5P56477 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Irf5P56477 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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