Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms