Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GferP56213 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GferP56213 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GferP56213 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
GferP56213 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms