Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms