Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd4P46935 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms