Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtlP38585 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtlP38585 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtlP38585 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms