Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin1P35438 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grin1P35438 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms