Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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