Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms