Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms