Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NefhP19246 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NefhP19246 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NefhP19246 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NefhP19246 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms