Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pou4f1P17208 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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