Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms